Metodika hodnocení diverzity jednonukleotidových polymorfismů (SNP) v kandidátních genech rezistence vůči infekčním onemocněním u včely medonosné

Abstract

Certifikovaná metodika obsahuje detailní popis laboratorní analýzy založené na molekulárně-genetickém přístupu využívajícím panel jednonukleotidových polymorfizmů (SNP) u genů kandidátních pro rezistenci a imunitní odpověď za účelem vyhodnocení genetické variability v těchto genech včely medonosné v České republice. Byl sestaven panel 13 validních, polymorfních lokusů vhodných pro rutinní testování metodou sekvenování za primerem, tzv. SNaPshot, která je spojena fluorescenční kapilární elektroforézou a amplifikací genů pomocí multiplexní polymerázové řetězové reakce (PCR).The certified methodology contains a detailed description of a laboratory analysis based on a molecular genetic approach using a panel of single nucleotide polymorphisms (SNPs) in candidate genes for resistance and immune response to evaluate genetic variability in these genes in honey bees in the Czech Republic. A panel of 13 valid, polymorphic loci suitable for routine testing was assembled using a primer sequencing method (SNaPshot), which is coupled with fluorescence capillary electrophoresis and gene amplification by multiplex polymerase chain reaction (PCR).